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Estatística Genômica - 2ª Edição

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Aplicada a populações derivadas de cruzamentos controlados

Neste livro, agora em sua segunda edição, revista, são apresentados os princípios básicos tanto da genética quanto da estatística matemática e experimental, que possibilitam ao leitor absorver conhecimentos fundamentais sobre técnicas biométricas a serem utilizadas na análise genômica. São abordados os métodos mais utilizados em estudos de segregação de marcadores, mapeamento genético e análise de QTLs em populações derivadas de cruzamentos, como retrocruzamentos, duplo-haplóides, RILs e gerações F2 a Fn.

Título: Estatística Genômica - 2ª Edição
Autores: Ivan Schuster e Cosme Damião Cruz
Editora: Editora UFV
ISBN: 9788572693394
Assunto: Livros
Idioma: Português
Data de Lançamento: 2008
Número de Páginas: 568
Tamanho: 26,5x18,5
Edição: 2

CAPÍTULO 1
Introdução 13
Genética mendeliana 14
Divisão celular 22
Ligação genética, permutação e recombinação 24
Estudo da ligação fatorial na descendência de retrocruzamento 30
Estudo da ligação fatorial na descendência F2 34
Ordenamento de genes 38
Interferência 38
Funções de mapeamento 41
Tipos de mapeamento 42
Populações de mapeamento 44
Marcadores moleculares 48
Bases moleculares dos mercadores de DNA 59
Escores de géis com a finalidade de mapeamento genético 63

CAPÍTULO 2 - Introdução à Estatística Matemática 65
Probabilidade 65
Leis de probabilidade 65
Variável aleatória 69
Função densidade 69
Função de distribuição acumulada 70
Distribuição 70
Esperança matemática 70
Momentos 71
Distribuição binomial e multinomial 73
Distribuição de Poisson 83
Distribuição de quiquadrado 92

CAPÍTULO 3 - Análise de Locos Individuais 107
Seleção de mercadores 107
Sistemas de acasalamentos 112
Teste de segregação 123
Freqüências esperadas para a segregação de um único loco 129

CAPÍTULO 4 - Análise de Pares de Locos - Máxima Verossimilhança 135
Método da máxima verossimilhança 135
Propriedades dos estimadores 137
Estimadores de máxima verossimilhança 138
Estimação da porcentagem de recombinação 143
Testes de hipótese 164

CAPÍTULO 5 - Análise de Pares de Locos - Porcentagem de Recombinação 167
Considerações gerais 167
Tipos de população 169
População derivada de retrocruzarnento 170
População F2 174
População de duplohaploides 208
População de RiLs 210
Linhas avançadas por autofecundação 214
Variância da freqüência de recombinação 215
Variância e viés obtidos por bootstrap 217
Intervalo de confiança para a freqüência de recombinação 222
Tamanho da população de mapeamento
Tamanho de população para mercadores dominantes em repulsão 227

CAPÍTULO 6 - Análise de Pares de Locos - Grupos de Ligação 233
Introdução 233
Interferência entre regiões cromossômicas 235
Funções de mapeamento 240
Estabelecimento da melhor ordem de ligação 243
Definindo a melhor ordem para n locos 252
Análise multilocos 258
Ligação fatorial como causa de correlação 269

CAPÍTULO 7 - Análise de QTLs - Caráter Quantitativo 279
Introdução 279
Média e variância genotípica 287
Componentes da variância genotípica 289
Variância aditiva 294
Variância atribuída aos desvios da dominância 297
Variância atribuída à epistasia 299
Análise molecular de caracteres quantitativos 304
Contribuições da genética molecular 305
Utilização de mercadores moleculares no melhoramento 311
Distribuição normal 314

CAPÍTULO 8 - Análise de QTLs ~ Mapeamento por Marcas Simples 323
Introdução 323
Diferenças entre grupos de marcadores 325
População de retrocruzamento 326
População F2 - mercadores codominantes 348
População F2 - mercadores dominantes 373
População de RiLs 391
População de duplohaploides 410

CAPÍTULO 9 - Análise de QTLs - Mapeamento por Intervalo Simples 429
Introdução 429
Mapeamento por intervalos em populações F2 - mercadores codominantes 431
Mapeamento por intervalos em populações F2 - marcadores dominantes 467
Mapeamento por intervalos em populações de retrocruzamento 475
Mapeamento por intervalos em populações de duplo-haplóides 488
Mapeamento por intervalos em populações de RiLs 493

CAPÍTULO 10 - Análise de QTLs-Mapeamento por intervalo Composto 499
Introdução 499
Considerações gerais sobre análises de regressão e correlação 501
Propriedades da regressão múltipla no mapeamento de QTLs 528
Mapeamento por intervalo composto 533
Seleção de cofatores 536
Testes de hipótese e significância para análise de QTL 548

REFERÊNCIAS 557

Apêndice 563

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